年末調整でやってはいけない5つのミス【住宅ローン・保険・ふるさと納税編｜2025年版】

ミス① 住宅ローン控除の「年違い」提出／調書方式の誤解

よくある症状：前年分の申告書を提出、その年分のページ未提出／調書方式なのに残高証明を探し回る／連帯債務・共有の按分を誤記。

対策（やること）

• 提出年のページだけ使用（税務署から届く冊子の「当年」欄）。
• 方式確認：借入先が調書方式対応なら、会社への年末残高等証明書の提出は不要（案内に従う）。
• 連帯債務・共有：各人が自分の持分×年末残高で記入。明細メモを作って転記。

リカバリー（やってしまったら）

社内締切内：差替え・再提出。締切後：その年分は確定申告で適用（e-Tax可）。

ミス② 保険料控除証明の添付漏れ・区分ミス

よくある症状：生命保険（新・旧区分／個人年金／介護医療）の入力漏れ、地震保険の未添付、iDeCoの証明書未提出。

対策（やること）

• 10〜11月に届く控除証明をメール・郵便・マイページで全件回収。
• 生命保険は新契約/旧契約の区分を入力、個人年金・介護医療も別欄に。
• iDeCo/小規模共済は運営管理機関の「掛金払込証明書」を添付/アップロード。

リカバリー

社内締切内：再提出で訂正。年越し後：確定申告で控除追加が可能（源泉徴収票＋証明書）。

ミス③ ふるさと納税を年末調整で処理できると思い込む

結論：ふるさと納税（寄附金控除）は年末調整では扱いません。ワンストップ特例を使うか、確定申告で申請します。

要注意シナリオ

• 初年度の住宅ローン控除で確定申告をする → その年はワンストップ特例が無効。寄附分もまとめて確定申告へ。
• 6自治体以上に寄附 → ワンストップ不可 → 確定申告が必要。

リカバリー

年明け〜3月の確定申告期間に、寄附金受領証（または寄附明細）で申請。給与だけならe-Taxの入力は短時間で完了します。

ミス④ 会社の締切に間に合わない／氏名・住所・マイナンバー不整合

よくある症状：書類到着を待って後手に回る／旧姓・旧住所のまま／マイナンバー未登録。

対策（やること）

• 締切を先にカレンダー登録（通知も設定）。
• 氏名・住所変更があれば先に会社へ届出。控除証明の再発行は各社マイページが最速。
• マイナンバーは初回に登録。未登録だと受付保留になることあり。

リカバリー

間に合わなかったら、その年分は確定申告で適用。会社には「年末調整に間に合わなかったため確定申告で対応します」と連絡。

ミス⑤ 年末調整の対象外なのに“済んだ”と思い込む（副業・2か所給与・株の譲渡等）

ポイント：年末調整は主たる給与の精算に限られます。次のケースは確定申告が必要になりやすいです。

• 年の途中で退職して年末在籍なし／2か所以上から主たる給与がある
• 給与収入が2,000万円超
• 副業所得・不動産所得・株式等の譲渡や配当の申告が必要

リカバリー

年末調整はやれる範囲だけ反映。残りは2〜3月の確定申告で精算すればOK。源泉徴収票や支払調書、取引報告書を保存しておきましょう。

おまけ：ミスを減らす小ワザ3つ

• 書類フォルダの一本化：「年末調整_2025」フォルダをPC/クラウドに作り、PDF・画像を集約。
• “先に入力”方式：会社のWeb申告フォームに先に入力→不足書類だけチェックバック。
• 連絡先メモ：保険会社・金融機関・iDeCo運営の連絡先を1枚にまとめ、再発行を迅速化。