住宅ローン控除（住宅借入金等特別控除）は、原則“初年度は確定申告”が必要です（2年目以降は勤務先の年末調整で対応できる場合あり）。
2025年の申告は、マイナポータル連携＋e-Taxを使うと、住所・氏名・源泉徴収票情報などの手入力が大幅に減り、迷わず・最短で完了します。
本記事はスマホ/PCの画面フローに沿ったチェックリストと、共有名義・連帯債務・借換などの注意点をまとめた実務ガイドです。
この記事でわかること
- 初年度と2年目以降の違い（年末調整との役割分担）
- マイナポータル連携・e-Taxの事前準備と要する時間
- 必要書類の揃え方と、電子データの扱い
- スマホ/PC別の入力手順テンプレ（コピペ用）
- 共有名義・連帯債務・借換・増改築のつまずきポイント
- 提出前の最終チェックリストとQ&A
まず理解したい全体像
初年度：確定申告で適用。年末残高等証明書、契約・登記に関する情報の入力が必要。
2年目以降：勤務先の年末調整で適用できるケースが一般的（会社の運用に従う）。年末調整に間に合わなければ確定申告で挽回できます。
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事前準備（15〜30分）
- マイナンバーカード（スマホNFCまたはICカードリーダー）
- マイナポータルの利用準備：初回は利用者登録とアプリ設定
- e-Taxの方式決定：マイナンバーカード方式 or ID・パスワード方式（税務署で発行）
- 必要書類（電子/紙のどちらか）
- 年末残高等証明書（金融機関）
- 売買契約書/請負契約書（写し）
- 登記事項証明書（家屋の登記情報）
- 源泉徴収票（勤務先）
- 増改築等の場合は該当書類（契約・検査済証 等）
- 共働き/共有名義の人は持分割合と借入内訳メモ
電子データでの集め方（最短）
- 年末残高等証明書：銀行アプリ/ネットバンキングでPDF再発行可のケース増。届かない時の対処参照。
- 源泉徴収票：会社の人事システムからPDFダウンロード可の場合あり（社内ルール優先）。
- 登記・契約書：紙のスキャンでOKのことが多い。300dpi程度を目安、ファイル名は
2025_homeloan_氏名_書類名.pdfで統一。
スマホで申告：マイナポータル連携→e-Tax（概要フロー）
- スマホにマイナポータルアプリを入れる→ログイン→連携設定。
- 確定申告書等作成コーナー（スマホ版）へ→マイナンバーカード方式を選択→案内に従いマイナポータルと連携。
- 給与所得の項目で、源泉徴収票の自動入力（取得できる範囲は年度・連携状況で変動）。不足は手入力。
- 住宅借入金等特別控除の画面へ→家屋の所在地・床面積・取得日・入居日・取得対価等を入力。
- 借入先・年末残高を入力→年末残高等証明書の内容に一致させる。
- 共有名義/連帯債務なら持分割合・各自の借入額を入力。
- 控除額計算を確認→マイナンバーカードで署名送信→控え（PDF）をクラウド保存。
PCで申告：カードリーダー or スマホNFCで署名
- 確定申告書等作成コーナー（PC版）にアクセス→ログイン。
- 所得の入力→給与（源泉徴収票）を転記。マイナポータル連携が使える場合は取り込み。
- 住宅借入金等特別控除→案内に沿って家屋・借入・入居情報を順に入力。
- 添付書類の提出方法を選択（電子/郵送）。可能なら電子添付がラク。
- 計算結果を確認→電子署名→送信→受信通知を保存。
入力時の“よくあるつまずき”と回避策
- 入居日・取得日の取り違え：入居日＝実際に住み始めた日。鍵渡しや決済日とは異なることあり。
- 床面積の判定：登記簿の登記面積をベース。50㎡要件（特例で緩和の期もあり）や合計所得の上限は年度により変動し得るため、最新要件を確認。
- 借換・複数口ローン：全ての借入先の年末残高を入力。借換時期によって旧ローンの扱いが変わる。
- 共有名義・連帯債務：各人がそれぞれ申告し、持分割合/返済負担に応じて控除。片方へまとめて申告はNG。
- 増改築・長期優良住宅など特例：必要書類が増える。工事完了日・証明書類の抜けに注意。
必要書類チェックリスト（初年度）
- □ 年末残高等証明書（金融機関ごと）
- □ 売買契約書/請負契約書（写し）
- □ 登記事項証明書（家屋）
- □ 源泉徴収票（勤務先）
- □ 増改築・長期優良住宅などの証明書（該当時）
- □ 本人確認書類（マイナンバーカード等）
提出前の最終チェック
- □ 入居日・取得日・床面積・年末残高に相互矛盾がない
- □ 共有名義/連帯債務：各自で申告し、割合が一致
- □ 電子データは300dpi程度で読み取り、ファイル名を整理
- □ 送信後の受信通知・申告書控えPDFをクラウド保存
スケジュール設計（例）
〜12月：書類集め（届かない書類の再発行）／1月：e-Tax準備・マイナポータル連携／2月上旬：下書き入力→不足書類回収／2月中旬〜3月：本申告→控え保存。
スマホ/PC別・入力テンプレ（コピペ用）
【住宅借入金等特別控除の入力メモ】・取得対価（建物／土地）：
・床面積（登記）：
・家屋の新築/取得/増改築の別：
・取得日・入居日：
・長期優良/低炭素住宅の別：
・借入先名： 残高／年 利率／借入年月日：
・共有名義の場合の持分（自分）： ％
・連帯債務の返済負担割合（自分）： ％
ケース別の注意点
共有名義・連帯債務
- 各人がそれぞれ申告し、持分割合や返済負担割合で控除を計算。
- 片側の所得が上限等により控除しきれない場合も、一方へ合算は不可。
借換
- 借換前後のローン情報を把握。年末残高は現ローンが基準。
- 旧ローン分の年中残高がある/なしで入力が変わることがある。
別居・単身赴任
- 主たる居住用であることが前提。実態上の居住関係に注意。
増改築・長期優良住宅等
- 要件・必要証明書が増える。工事完了日や証明書名を漏れなく。
よくあるQ&A
Q. 初年度の書類が間に合わない場合は？
A. 年末調整ではなく確定申告で適用します。証明書が整い次第、e-Taxで提出しましょう。
Q. 2年目以降も確定申告が必要？
A. 多くは年末調整で適用可能ですが、会社の運用により異なります。年末調整に乗らない場合は確定申告で対応可。
Q. 電子の年末残高等証明書でよい？
A. 会社/税務の運用により可否が分かれます。e-Taxでは電子添付が便利ですが、最新の案内に従ってください。
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